Новости

Диагностика и лечение клещевого риккетсиоза (пятнистой лихорадки скалистых гор и других пятнистых лихорадок группы риккетсиозов, эрлихиозов и анаплазмозов) в Cоединенных Штатах Америки

Источник: Biggs H.M., Behravesh C.B., Bradley K.K., et al. MMWR Recomm Rep. 2016; 65 (2): 1-44. doi: 10.15585/ mmwr.rr6502a1.

PMID: 27172113

Клещевые риккетсиозы по-прежнему протекают с развитием тяжелых форм заболевания и смертельными исходами у здоровых взрослых и детей, несмотря на недорогую и эффективную антибактериальную терапию. Ранняя диагностика заболевания имеет решающее значение, по­скольку на начальных этапах антибактериальная терапия наиболее эффективна. Первые признаки заболевания неспецифичны либо могут имитировать другие заболевания, что существенно затруд­няет своевременную диагностику. Продолжают выявляться ранее не описанные клещевые риккет­сиозы: в частности, с 2004 г. в США были описаны 3 дополнительных возбудителя, вызывающих инфекцию у человека: Rickettsia parkeri, Ehrlichia muris-like agent и Rickettsia вида 364D. В данном докладе обновлены рекомендации Центра по контролю и профилактике заболеваний (Centers for Disease Control and Prevention - CDC) 2006 г. по диагностике и лечению клещевых риккетсиозов в США и включена информация о практических аспектах эпидемиологии, клинической оценки, ле­чения, лабораторной диагностики и профилактики клещевых риккетсиозов. Этот доклад был раз­работан отделом риккетсиозов и зоонозов Центра по контролю и профилактике заболеваний в со­трудничестве со сторонними клиническими и академическими экспертами, а также специалистами в области общественного здравоохранения для того, чтобы предоставить врачам и работникам здравоохранения информацию: 1) о ключевых эпидемиологических особенностях и клинических проявлениях передаваемых клещами риккетсиозов; 2) о том, что доксициклин - предпочтитель­ный препарат для лечения при подозрении на клещевой риккетсиоз у взрослых и детей; 3) о том, что ранняя эмпирическая антибактериальная терапия может предотвратить тяжелую форму забо­левания и смертельный исход; 4) о соответствующих лабораторных анализах для подтверждения диагноза, их возможностях и ограничениях; 5) о необходимости сообщения о вероятных и под­твержденных случаях клещевых риккетсиозов в органы здравоохранения.

Риккетсиозы и ку-лихорадка у путешественников (2004-2013 гг.)

Ключевые слова: ку-лихорадка, риккетсиозы, путешествия, тиф

Источник: Delord M., Socolovschi C., Parola P. Travel Med Infect Dis. 2014; 12 (5): 443-58. doi: 10.1016/j. tmaid.2014.08.006.

PMID: 25262433

Риккетсиозы связаны с укусами членистоногих, включая клещей, блох и вшей, в то время как путь передачи ку-лихорадки чаще ингаляционный (связан с вдыханием контаминированных аэро­золей) или алиментарный (потребление молока зараженных животных). Эти зоонозы появились в поле зрения медицины путешествий 20 лет назад. В данной работе представлен обзор случаев риккетсиоза и ку-лихорадки у путешественников с акцентом на случаях, отмеченных в послед­ние 10 лет. Наиболее часто встречаются 2 разновидности сыпного тифа: африканская клещевая лихорадка и средиземноморский сыпной тиф. Хотя в типичных случаях эти виды лихорадки про­текают доброкачественно, без серьезных осложнений, были описаны случаи развития кардио­логических и неврологических осложнений при африканской клещевой лихорадке и отдельные случаи развития полиорганной недостаточности с летальными исходами при средиземноморском сыпном тифе. Крысиный сыпной тиф и ку-лихорадку по-прежнему трудно распознавать и диагно­стировать, поскольку данные заболевания часто проявляются лишь лихорадкой. В лабораториях с возможностью проведения полимеразной цепной реакции (ПЦР) могли бы быть применены но­вые молекулярные методы исследования, особенно при анализе образцов, полученных со струпа. В качестве препарата выбора при подозрении на риккетсиозы или ку-лихорадку, а также при лихо­радке неизвестного генеза у путешественников, возвратившихся из опасных географических зон, следует рассматривать доксициклин.

Первичный аффект (струп) на волосистой части головы и шейная лимфаденопатия после присасывания клеща: полиэтиологичный синдром

Источник: Dubourg G., Socolovschi C., Del Giudice P., et al. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2014; 33 (8): 1449-56. doi: 10.1007/ S10096-014-2090-2.

PMID: 24682865

В Национальном центре по изучению риккетсиозов Франции были проанализированы клиниче­ские и эпидемиологические особенности 56 пациентов с синдромом SENLAT [Scalp Eschar associated with Neck Lymphadenopathy After a Tick bite - первичный аффект (струп) на волосистой части головы и шейная лимфаденопатия после присасывания клеща]. Для молекулярного и серологического ана­лиза были получены соскобы, мазки-отпечатки, биоптаты струпа, а также образцы гемолимфы клещей и крови пациентов. Синдром SENLAT чаще всего регистрировался у детей (p<0,05), далее следо­вала возрастная группа пациентов от 40 до 70 лет; чаще отмечался у лиц женского пола (p<0,05). По сезонности были выявлены 2 пика: весной (55%) и осенью (30%). Возбудитель был выделен в 18 случаях, в том числе в 13 случаях - Rickettsia slovaca с двумя случаями коинфекции Rickettsia raoultii и в 1 случае - Rickettsia sibirica mongolitimonae. Другими возможными возбудителями, обна­руженными в клещах, были Candidatus R. rioja, Coxiella burnetii и Borrelia burgdorferi. Клещом-пере­носчиком почти во всех случаях был Dermacentor marginatus, за исключением 1 случая, где в каче­стве клеща-переносчика служил Ixodes ricinus. В данной работе было показано, что синдром SENLAT является клиническим проявлением местной инфекции, контролируемой иммунной системой, не­специфичной по отношению как к возбудителю, так и к переносчику.

Генетическая вариабельность rickettsia spp. в ixodes persulcatus/ixodes trianguliceps симпатрических областей Восточной Сибири (Россия): выявление новых видов candidatus rickettsia

Ключевые слова: генетический анализ, Ixodes persulcatus, Ixodes trianguliceps, бактерии Rickettsia, Россия

Источник: Igolkina Y.P., Rar V.A., Yakimenko V.V., et al. Infect Genet Evol. 2015; 34: 88-93. doi: 10.1016/ j.meegid.2015.07.015.

PMID: 26190452

Rickettsia spp. являются возбудителями целого ряда заболеваний у человека. Эти бактерии переносятся членистоногими, включая иксодовых клещей. ДНК ряда Rickettsia spp. была вы­явлена у клещей Ixodes persulcatus, однако ассоциации клещей Ixodes trianguliceps с Rickettsia spp. неизвестны. В данном исследовании были получены и проанализированы образцы крови мелких млекопитающих (n=108), гемолимфы голодных взрослых клещей I. persulcatus (n=136), I. persulcatus (n=12) и I. trianguliceps (n=34), паразитирующих на полевках, из двух ареалов со­вместного обитания I. persulcatus/I. trianguliceps в Восточной Сибири. Образцы гемолимфы кле­щей и крови млекопитающих были проанализированы методом ПЦР на наличие ДНК Rickettsia spp. В клещах было выявлено 3 различных вида риккетсий, однако в крови исследуемых по­левок риккетсий не обнаружено. ДНК Candidatus Rickettsia tarasevichiae обнаружена у 89,7% голодных клещей I. persulcatus, 91,7% напившихся кровью клещей I. persulcatus и 14,7% клещей I. trianguliceps. ДНК Rickettsia helvetica была обнаружена у 5,9% клещей I. trianguliceps. Кроме того, у 32,4% клещей I. trianguliceps обнаружена новая генетическая разновидность риккетсий. Был проведен анализ последовательностей генов 16S rRNA, gltA, ompA, оmpB и sca4 и в соответ­ствии с генетическими критериями новый генетический вариант риккетсий был классифициро­ван как новый вид Candidatus Rickettsia. Авторы предложили название данного вида - Candidatus Rickettsia uralica в соответствии с местом его первоначального обнаружения. Было установлено, что Candidatus Rickettsia uralica относится к группе возбудителей сыпных лихорадок. Данные, полученные в этом исследовании, позволяют предположить, что Candidatus Rickettsia uralica ас­социирован с клещами I. trianguliceps.

Оценка количества копий rickettsia rickettsii в крови пациентов с пятнистой лихорадкой скалистых гор установила тенденцию к суточным циклическим колебаниям бактериемии

Источник: Kato C., Chung I., Paddock C. Clin Microbiol Infect. 2016; 22 (4): 394-6. http://dx.doi.org/ 10.1016/j.cmi.2015.12.019

Инфицирование Rickettsia rickettsii, облигатной внутриклеточной грамотрицательной бак­терией, приводит к развитию пятнистой лихорадки Скалистых гор - одного из заболеваний с наиболее высокой летальностью среди всех известных инфекций. Поскольку R. rickettsii про­никает преимущественно в фиксированные эндотелиальные клетки кровеносных сосудов мелкого и среднего калибра, пока предложено немного количественных оценок бактериемии для пятни­стой лихорадки Скалистых гор, и на основании ограниченных данных предполагается, что в пе­риферической крови пациентов циркулирует небольшое число R. rickettsii. Данное наблюдение было ранее описано исследователями, которые установили, что R. rickettsii трудно обнаружить при окраске препаратов периферической крови пациентов даже при тяжелой форме заболевания.

Сравнительное метагеномное пролифилирование симбиотических бактериальные сообществ, ассоциированных с клещами ixodes persulcatus, ixodes pavlovskyi и dermacentor reticulatus

Источник: Kurilshikov A., Livanova N.N., Fomenko N.V., et al. PLoS One. 2015; 10 (7): e0131413. doi: 10.1371/ journal.pone.0131413. eCollection 2015.

PMID:26154300

Клещи Ixodes persulcatus, Ixodes pavlovskyi и Dermacentor reticulatus участвуют в трансмис­сивной передаче ряда патогенов, вызывающих клещевые заболевания у людей и животных. Поскольку они встречаются в пригородах крупных городов, сельскохозяйственных районах и популярных для туризма зонах и часто нападают на людей и домашний скот, необходимы све­дения о микробиомах данных членистоногих. Используя метагеномное профилирование 16S, авторы провели анализ бактериальных сообществ, ассоциированных с клещами I. persulcatus, I. pavlovskyi и D. reticulatus, собранными в Новосибирской области России. В настоящем ис­следовании было изучено в целом 1214 клещей. Выделенные из клещей ДНК были обобще­ны в соответствии с видом и полом клещей. Секвенирование V3-V5 доменов генов 16S рРНК было проведено с использованием платформы ILLumina Miseq. В проанализированных сообще­ствах превалировали следующие бактерии: Acinetobacter (у всех 3 видов клещей), Rickettsia (I. persulcatus и D. reticulatus) и Francisella (D. reticulatus). Сиквенсы B. burgdorferi sensu lato и B. miyamotoi выявлены в клещах I. persulcatus и I. pavlovskyi, но не в D. reticulatus. Пулированные образцы от всех изученных видов клещей содержали также бактерии семейства Anaplasmataceae, хотя частота их встречаемости была низкой. ДНК A. phagocytophilum и Candidatus Neoehrlichia mikurensis впервые выявлена в клещах I. pavlovskyi. Отмечались статистически значимые меж­видовые различия по числу видов бактерий, а также внутривидовые различия в зависимости от половой принадлежности клещей. Бактериальные сообщества, ассоциированные с клещами I. pavlovskyi, демонстрировали большее биоразнообразие по сравнению с таковыми в клещах I. persulcatus и D. reticulatus. Структура бактериального сообщества также различалась по изу­ченным видам клещей, как это было показано перестановочным анализом переменных с ис­пользованием диссимилярной метрики Брея-Куртиса (p=0,002). Межполовые различия были подтверждены тестом PERMANOVA для клещей I. persulcatus (p=0,042) и I. pavlovskyi (p=0,042). Данное исследование показало, что метагеномное профилирование 16S может быть исполь­зовано для быстрой оценки встречаемости бактерий, представляющих интерес для медицины, в популяциях клещей, населяющих различные природные биотопы, а значит, и для оценки эпи­демиологической опасности изучаемых зон.

Инфекции, вызываемые candidatus rickettsia tarasevichiae, в центрально-восточном регионе Китая: серии случаев

Источник: Liu W., Li H., Lu Q.B., et al. Ann Intern Med. 2016; 164 (10): 641-8. doi: 10.7326/M15-2572.

PMID:27019406

Впервые об инфекционном заболевании у человека, вызванном Candidatus Rickettsia tarasevichiae (CRT), в Северо-Восточном регионе Китая сообщалось в 2012 г.

Цель - описать клинические проявления и лабораторные данные пациентов, инфицирован­ных CRT, в Центрально-Восточном регионе Китая.

Дизайн. Серии случаев.

Исследовательский центр. "Дозорный" госпиталь для синдрома острой лихорадки с тромбоцитопенией (severe fever with thrombocytopenia syndrome - SFTS) в Центрально-Восточном регионе Китая в 2014 г.

Выборка. Госпитализированные пациенты с SFTS-подобными заболеваниями.

Методы. Для диагностики CRT-инфекции проводили молекулярные и серологические ана­лизы. Данные о клинических проявлениях и лабораторных показателях были взяты из историй болезни.

Результаты. На основании результатов ПЦР и секвенирования у 56 из 733 обследованных пациентов была диагностирована CRT-инфекция. У всех пациентов клинические проявления были неспецифичны и включали такие симптомы, как лихорадка (96%), общее недомогание (88%), миалгия (57%), кашель (25%) и головокружение (14%). Только у 2 пациентов была сыпь. Кроме того, у 16% пациентов был первичный аффект на месте укуса клеща (струп), у 29% - лимфаденопатия, у 100% - желудочно-кишечные симптомы, у 34% - неврологические симптомы, у 43% - геморрагические проявления и у 23% были признаки утечки плазмы. Тромбоцитопения наблюдалась у 70% пациентов, лейкопения - у 59%, лимфопения - у 45%, повышенные уровни активности лактатдегидрогеназы - у 82%, аспартатаминотрансферазы - 70%, аланинамино-трансферазы - у 54% и креатининфосфокиназы - у 46%. Коинфицирование вирусом SFTS было отмечено у 66% пациентов, 8 из 56 пациентов умерли.

Ограничения. Пациенты с CRT не получали терапии по поводу инфекции, так как она была выявлена ретроспективно. Это исследование не было популяционным, и его результаты не могут быть распространены на всех пациентов с CRT.

Заключение. Candidatus R tarasevichiae следует рассматривать в рамках дифференциальной диагностики у лихорадящих пациентов с SFTS-подобными заболеваниями в эндемических рай­онах.

Подход к классификации и таксономии в рамках семейства rickettsiaceae, основанный на формальном анализе строя

Ключевые слова: средняя удаленность (дистантность), классификация, формальный анализ строя, геном, бактерии Rickettsia, таксономия

Источник: Shpynov Pozdnichenko N., Gumenuk A. Microbes Infect. 2015; 17 (11-12): 839-44. doi: 10.1016/j. micinf.2015.09.012.

PMID: 26423020

Геномные последовательности 36 Rickettsia и Orientia были проанализированы с помощью формального анализа строя (Formal Order Analysis - FOA). Этот подход принимает во внимание расположение нуклеотидов в каждой последовательности. Для сравнения геномов использова­лась числовая характеристика: средняя удаленность - д. Результаты данного исследования под­твердили ранее предложенное разделение на 3 группы в рамках рода Rickettsia, включая группу тифов, классических пятнистых лихорадок и предковую группу, а также Orientia в качестве само­стоятельного рода. По данным формального анализа строя Rickettsia felis URRWXCal2 и R. akari Hartford не относились к той же группе, в связи с этим выделение так называемой переходной группы риккетсий не подтверждено с помощью данного анализа.

Геномная последовательность клещевого патогена rickettsia raoultii

Источник: El Karkouri K., Mediannikov O., Robert C., et al. Genome Announc. 2016; 4 (2): pii: e00157-16. doi: 10.1128/ genomeA.00157-16.

PMID:27103706

Rickettsia raoultii является возбудителем группы клещевых пятнистых лихорадок, вызываю­щим первичный аффект на волосистой части головы (струп) и шейную лимфаденопатию после присасывания клеща (синдром SENLAT) у человека. В данной работе описана геномная последо­вательность R. raoultiistrain Khabarovsk (T) [CSUR R3 (T), ATCC VR-1596 (T)], который был выделен из Dermacentor silvarumtick, собран в России.

Происхождение и эволюция плазмид риккетсий

Источник: El Karkouri K., Pontarotti P., Raoult D., Fournier P.E. PLoS One. 2016; 11 (2): e0147492. doi: 10.1371/journal. pone.0147492. eCollection 2016.

PMID: 26866478

Различные виды риккетсий являются облигатными внутриклеточными паразитами, которые прошли редукционную эволюцию генома. Несмотря на их аллопатрический жизненный цикл, почти 26 обнаруженных в настоящее время видов риккетсий имеют плазмиды.

Цель - изучить происхождение, эволюционную историю и предполагаемые роли плазмид риккетсий, исследовать эволюционные процессы, которые сформировали 20 плазмид, принад­лежащих 11 видам риккетсий, используя сравнительную геномику и филогенетический анализ между геномами риккетсий, микробными и немикробными геномами.

Результаты. Плазмиды были по-разному представлены среди различных видов риккетсий. 11 видов риккетсий имели от 1 до 4 плазмид размером от 12 до 83 kb. Авторы реконструировали pRICO, последний общий предшественник существующих в настоящее время плазмид риккетсий. pRICO - это вертикально передаваемая плазмида главным образом от Rickettsia/Orientia chromosomes, имело место вертикальное расхождение в каждом виде с образованием одной или нескольких плазмид. Эти плазмиды также прошли редуктивную эволюцию с прогрессивной по­терей генов, подобную таковой в хромосомах риккетсий, что, вероятно, привело к образованию криптичных плазмид либо к их полной утрате. Более того, в плазмидах риккетсий выявлены ORFans, древние генные дупликации, и свидетельство горизонтальной передачи генов между ге­номами риккетсий и других микроорганизмов, главным образом рода α/γ-протеобактерий. Гены, имевшие отношение к сохранению и пластичности плазмид а также к адаптации и резистент­ности к стрессу, в большинстве своем эволюционировали путем вертикальных и/или горизон­тальных переносов. Гены, участвовавшие в транспорте и метаболизме нуклеотидов/углеводов, находились под влиянием лишь вертикальных процессов, в то время как гены, участвовавшие в биогенезе клеточной стенки/мембраны/оболочки, контроле клеточного цикла, биосинтезе, транспорте и метаболизме аминокислот/липидов/коэнзима и вторичных метаболитов главным образом были подвержены горизонтальной передаче.

Заключение. Эволюция плазмид риккетсий - сложный процесс, начинавшийся с вертикаль­ного наследования с последующей редуктивной эволюцией, ассоциированной с увеличением сложности за счет горизонтальной передачи генов, а также дупликации генов и генезиса. Плазмиды являются пластичными и мозаичными структурами, которые могут играть важную биоло­гическую роль, сходную либо отличную от таковой у корезидентных хромосом в облигатности внутриклеточного жизненного цикла риккетсий.

Материалы данного сайта распространяются на условиях лицензии Creative Commons Attribution 4.0 International License («Атрибуция - Всемирная»)